Bap İçin 6 Kalem Malzeme Alınacaktır. (prof. Dr. Ergun Köse'nin 2021-094 Nolu Projesi İçin)

Kod

Malzeme Adı

Teknik Özellikleri

03.2.6.01

1.5 ml steril eppendorf tüp

-Ürün 1,5 ml hacminde olmalıdır.

-Ürün 5x 50 adetlik ambalajlarda steril olmalıdır.

-Ürün DNase-RNase PCR inhibitör içermemelidir.

-Ürün kilitli kapak özelliğinde olmalıdır.

-Ürün üzerinde hacim çizgileri olmalıdır.

-Ürün düşük DNA/RNA bağlama kapasitesinde olmalıdır.

03.2.6.01

0.5-10 mikrolitre steril filtreli pipet ucu

-Ürün 96’lık racklar içinde olmalıdır.

-Ürün steril, filtreli ve ekstra uzun formda olmalıdır.

-Ürün DNAse-RNAse-pirojen free olmalıdır.

-Ürün Iso 13485 standartları altında sentezlenmelidir.

-Ürün laboratuvarda kullanılan pipetlere uygun olmalıdır.

-Ürün 0.5-10 ul hacminde olmalıdır.

03.2.6.01

100-1000 mikrolitre steril filtreli pipet ucu

-Ürün 96’lık racklar içinde olmalıdır.

-Ürün steril, filtreli ve ekstra uzun formada olmalıdır.

-Ürün DNAse-RNAse-pirojen free olmalıdır.

-Ürün Iso 13485 standartları altında sentezlenmelidir.

-Ürün laboratuvarda kullanılan pipetlere uygun olmalıdır.

-Ürün 100-1000 ul hacminde olmalıdır.

03.2.6.01

DNA izolasyon kiti

-Gıda örneklerinden mikrobiyal DNA eldesinde kullanılabilmelidir.

-0,15 mm boyutlardaki garnet taş boncuklar içermelidir.

-Silika kolon temelli çalışmalıdır.

-Bakteri ve maya dahil tüm mikroorganizmalardan DNA eldesinde kullanılabilmelidir.

-Devamındaki mikrobiyota çalışmalarına uygun olmalıdır.

-PCR inhibitörlerini izolasyon sırasında başarı ile uzaklaştırabilmelidir.

-Kit boyutu olarak 0.5 ml olmalıdır.

-Laboratuvarımızda daha önceden denenmiş olmalı ve en geç 1 ay içerisinde teslim edilmelidir.

03.2.6.01

DNA temizleme (clean-up) kiti

-Ürün spin kolon prensibi ile çalışmalıdır.

-Ürün %95’in üzerinde DNA geri kazanımına olanak vermelidir.

-Ürün 10ug DNA’ya kadar temizleme yapabilmelidir.

-Ürün 70bp-10kb arasındaki büyüklükteki DNA molekülü ile çalışmaya uygun olmalıdır.

-Kit 50 örnek çalışmaya uygun olmalıdır.

03.2.6.01

Metagenomik dizileme kütüphane hazırlama kiti

-Ürün kütüphane hazırlık işlemini 3.5 saatte yapabilmelidir.

-Ürün 1ng-500ng arası DNA ile çalışmaya uygun olmalıdır.

-Ürün Illumina MiSeq platformuna uygun olarak dizayn edilmelidir, ve bu cihaza uygun protokole sahip olmalıdır.

-Ürün çeşitli kaynaklardan; gıda, biyolojik sıvı, kan gibi materyalden elde edilen genomik DNA’dan virüs, bakteri, arkea, fungus, protozon gibi organizma grupları için kullanıma uygun olmalıdır.

-Kit küçük genom yapılarında çalışmaya uygun olmalıdır.

-Kit bead-linked transposome prensibi ile çalışmalıdır.

-Kit şu sistemler ile kusursuz çalışmalıdır: HiSeq 2500, HiSeq 3000, HiSeq 4000, HiSeq X Five, HiSeq X Ten, iSeq 100, MiniSeq, MiSeq, MiSeqDx in Research Mode, NextSeq 1000, NextSeq 2000, NextSeq 550, NextSeq 550Dx in Research Mode, NovaSeq 6000.

-Ürün Amplicon Sequencing, De Novo Sequencing, Shotgun Sequencing, Whole-Genome Sequencing yöntemlerine kullanıma uygun olmalıdır.

-Kit şu varyant sınıfları için uygun olmalıdır: Chromosomal Abnormalities, Copy Number Variants (CNVs), Gene Fusions, Germline Variants, Insertions-Deletions (indels), Loss of Heterozygosity (LOH), Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs), Somatic Variants, Structural Variants.

-Ürünün hedef insert boyutu 350 bp olmalıdır.

-Ürünün kullanımı konusunda teklif veren firma teknik destek, gerekirse eleman desteği de sağlamalıdır.

-Uygun şartlar altında ürün teslim edilmelidir.